Hükümet Konağı, her iki giriş açıklığının alınlığında yer alan kitabesine göre II. Abdülhamid zamanında H.1305-1306/M.1887-1889 yıllarında Kaymakam Kami Efendi tarafından yaptırılmıştır. Kitabenin Osmanlı Türkçesi ile yazılmış  Kitabenin Türkçesi aşağıda yer alan metindeki gibidir:  “Padişahlar Padişah’ı Büyük Hazret-i Abdülhamid Han’ın Saltanatta oturanın ömrünü uzatsın Allah. Cihan (Dünya) O’nun sayesinde adalet ve kültüre sahip oldu. Ne zulme yer kalmadı ne de baykuşa ve uğursuzluğa yer kalmadı (sığınalı) Bu gönlü hoş eden yer Göynük’te yeni bir tarz üzere (yapılmıştır). Böyle bir binayı görmek değil düşünmek bile mümkün değilken, (şüpheliyken) yardımların en iyisi ile gayretle sebeplerini hazırladı, (Saydı). Bunu Kaymakam Kâmi Efendi yaptırdı. İlden Sancaktan her ne emredildiyse o şekilde yapıp Hakk’a hizmet için tamam eyledi. Bu binayı en seçkin tarzda gören Fikri cevher gibi tarih düşürdü. Yeni Hükümet Konağı benzersiz bir şekilde yapıldı. 1305-1306 (1889-1890)” 
Yapının en alt katında kütüphane, orta katta millî eğitim müdürlüğü, en üst katta ise maliyeye ait mal müdürlüğü, vergi dairesi ve icra müdürlüklerinden oluşan bölümler yer almaktadır.